Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms