Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd1Q9CQK7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms