Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms