Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc18Q9CQ07 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms