Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms