Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms