Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms