Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms