Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Epdr1Q99M71 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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