Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q99M08 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q99M08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q99M08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q99M08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q99M08 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q99M08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms