Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms