Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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