Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms