Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms