Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms