Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms