Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrabdQ99JY4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms