Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms