Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms