Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms