Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms