Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb6Q922F4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms