Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms