Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms