Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna2Q91X60 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms