Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx9Q91VH2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms