Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfxn3Q91V61 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms