Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms