Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fyco1Q8VDC1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms