Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Vmn1r200Q8R281 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Vmn1r200Q8R281 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Vmn1r200Q8R281 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Vmn1r200Q8R281 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Vmn1r200Q8R281 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r200Q8R281 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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