Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf183Q8QZS5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf183Q8QZS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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