Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgi3Q8K406 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms