Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssh3Q8K330 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms