Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms