Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcho1Q8K285 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcho1Q8K285 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms