Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cnppd1Q8K158 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnppd1Q8K158 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnppd1Q8K158 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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