Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt33aQ8K0Y2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms