Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms