Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LgsnQ8CIX8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LgsnQ8CIX8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms