Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms