Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms