Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RybpQ8CCI5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms