Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms