Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms