Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms