Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap4Q8BMK4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms