Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc9Q8BJN4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms