Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra5Q8BHJ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra5Q8BHJ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms