Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms