Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmes1Q810Q5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Nmes1Q810Q5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nmes1Q810Q5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmes1Q810Q5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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